宣城市疾病预防控制中心是由原来宣城市卫生防疫站、宣城市地方病防治所和宣城市结核病防治所合并组建而成。
宣城市疾病预防控制中心于2003年12月经宣城市政府批准，由原来宣城市卫生防疫站、宣城市地方病防治所和宣城市结核病防治所合并组建而成。
为宣城市卫生局直属事业单位，主要职能是在上级业务部门指导下，在宣城市委、市政府和市卫生局的领导下承担着宣城全市疾病预防控制和公共卫生技术管理和服务工作。
宣城市疾病预防控制中心遵循预防为主的方针，预防和控制传染病、地方病的发生和流行，开展公共卫生监测和技术服务，制定区域性各种传染病、地方病防治规划和防治预案，开展各种危害因素暴露人群的健康监护和相关疾病诊断、治疗，开展与人相关产品卫生质量监测和安全预警，为政府和卫生行政执法提供科学依据。
根据《疾病预防控制机构工作规范》的要求，宣城市疾病预防控制中心设立的内设科室有办公室、总务科、健康教育科、公共卫生科、职业病防治科、防疫科、计划免疫科、消毒杀虫科、结核病防治所、性病艾滋病防治科、血吸虫病防治所、地方病与慢性病防治科、质量管理科、检验科、预防医学门诊。